博研醫藥開發股份有限公司於2010年6月成立，公司初期以新藥研究為主軸，使用專有的前驅藥物合成技術平台，對既有學名小分子藥物進行化學合成修飾，開發具專利的創新藥物，致力於為患者提供新醫療選擇，同時為股東及利害關係人創造長期、永續的價值。
公司經過十年的研究與努力，成功建立了一個前驅藥物技術平台，此平台能持續支持新藥的研發，建構多樣化的候選藥物組合。
另外，BY-101於2019年1月獲得美國食品藥物管理局（FDA）的孤兒藥認定。此美國食品藥物管理局（FDA）之「孤兒藥認證」是特別針對罕見疾病藥物的一種特殊資格認定，目的是鼓勵醫藥產業來開發罕見疾病患者所需要之治療藥物。目前公司的BY-101已於台灣三家醫學中心啟動臨床二期試驗，而BY-101在未來取得藥證後，可享有7 年的專賣期。BY-102、BY-103為公司前驅藥物技術平台之產品，分別適用於多發性硬化症及急性血癌等適應症之治療。
2020年是博研醫藥的關鍵轉型年，從原來主力放在新藥研究的研發單位轉型為以臨床開發為主，研究為輔的利基型的商業公司。BY-101於2023年透過505(b)2通道進入美國FDA臨床2/3期的試驗，BY-101為急性骨隨性白血病(AML)適應症的新療效候選藥物。目前已於台灣三家醫學中心啟動臨床二期試驗(Phase 2b)，預計收案15名年齡介於18至75歲之新診斷之AML患者，後續將進一步推動臨床進度與授權合作機會。BY-102為博研使用專有前驅藥( pro-Drug )技術平台開發的全新候選藥物，計畫構思源於已上市之囗服錠劑瑪威克錠(德國默克產品)。針對瑪威克在服用上所面臨的低吸收率及相關副作用的問題，博研團隊開發出已獲專利核淮的前驅藥BY-102，能於體內穩定轉化為活性母藥並透過粉末微化技術，有效提升、服用便利且副作用更低的新一代囗服治療選擇。
公司亦主動和國內各學術/研究單位探討合作，協助將其研究之成果，導入新藥開發/臨床試驗的流程，為辛勤致力於生技新藥研究的國內學術/研究單位創造更大的價值。
公司於2015年及2024年獲得經濟部工業局核可為生技新藥公司。公司行政辦公室設於台北世界貿易中心國際貿易大樓。